Point sur la situation Covid en octobre 2025 : variant, dépistage, vaccination

Point sur la situation Covid en octobre 2025 : variant, dépistage, vaccination
Point COVID-19 : Circulation du virus, Variants et Dépistage (Octobre 2025)
La COVID-19 est désormais intégrée dans le dispositif de surveillance intégrée des infections respiratoires aiguës, avec une surveillance saisonnière accrue.
Circulation du virus et Variants
- L'immunité acquise (vaccination et infections passées) contribue à une diminution générale des formes graves.
- Le virus continue de muter, donnant naissance à de nouveaux sous-variants d'Omicron, caractérisés par une meilleure capacité de transmission et un certain échappement immunitaire.
- Le sous-variant le plus discuté est une nouvelle lignée d'Omicron, parfois nommée "Frankenstein" (XFG ou Stratus), ce surnom est jugé exagéré par des organismes comme l'Institut Pasteur.
- Les variants les plus récents sont généralement plus contagieux, mais la gravité des formes est similaire aux précédents variants d'Omicron, restant le plus souvent modérée (fièvre, maux de tête, toux, écoulement nasal, fatigue). Certains médecins notent une atteinte plus marquée de la gorge/enrouement.
Dépistage (Tests) : Les règles de prise en charge
Le dépistage de la COVID-19 est revenu à un régime de droit commun, avec une suppression de la prise en charge systématique par l'Assurance Maladie.
Ce qui est disponible :
- Tests Antigéniques TAG en officine: Non remboursés, le pharmacien réalise le TAG dans l'espace de confidentialité, mais l'acte n'est plus pris en charge par l'Assurance Maladie.
- Tests RT-PCR en laboratoire: Remboursés uniquement sur prescription médicale, référence pour la confirmation d'un diagnostic, en particulier en cas d'autotest positif.
- Autotests en vente libre: Non remboursés, un résultat positif doit être confirmé par un test RT-PCR et suivi de mesures de prévention vis-à-vis de l'entourage.
- Nous vous rappelons que désormais les pharmaciens peuvent s’inscrire gratuitement sur Santé.fr pour indiquer les missions qu’ils effectuent afin que les patients voient les officines proposant ce service. (Voir modalités dans l’article suivant)
Chiffres Clés de la COVID-19 en France (Semaine 40 - 2025)
La surveillance de la COVID-19 est intégrée à la surveillance globale des Infections Respiratoires Aiguës (IRA) :
- Activité syndromique (IRA) stable à des niveaux bas
- Indicateurs virologiques à l'hôpital en augmentation
- Traces dans les eaux usées : stabilisation après plusieurs semaines d'augmentation
- Positivité des tests (en médecine de ville) 27% des prélèvements testés étaient positifs au SARS-CoV-2 (pour les IRA).
Tendances spécifiques aux urgences et hospitalisations (réseau OSCOUR urgences)
Une reprise de l'activité liée aux IRA chez les adultes est observée :
- Passages aux urgences : Fin septembre (S39), une hausse de 37% des passages aux urgences et des hospitalisations pour des pathologies respiratoires a été observée chez les adultes par rapport à la semaine précédente.
- Taux d'incidence (estimation) : incidence des cas d'IRA vus en consultation de médecine générale stable chez les adultes (15-64 ans et 65 ans et plus) en S40 après une augmentation les semaines précédentes.
Variants en circulation (Données de séquençage)
- Variant Majoritaire : Les variants circulants restent des sous-lignages du variant Omicron.
- Variant à surveiller : Le sous-variant temporairement appelé "Frankenstein" (lignée issue d'Omicron) fait l'objet d'une surveillance renforcée en raison de sa croissance, mais est jugé non préoccupant à ce stade en termes de gravité clinique par les autorités sanitaires (Institut Pasteur, SPF).
Efficacité du vaccin actuel
Selon les autorités sanitaires (comme l'OMS et l’EMA), les vaccins actuels restent efficaces pour prévenir les formes graves, les hospitalisations et les décès liés à la COVID-19.
Pour la campagne de vaccination 2025/2026, des vaccins monovalents (une seule souche) adaptés au dernier variant en circulation, tels que le Comirnaty LP.8.1, sont utilisés. Ces vaccins ont été conçus pour cibler les variants les plus récents et ont montré une meilleure réponse immunitaire contre les sous-lignages circulants, y compris XFG.
Pour en savoir plus :
Santé publique France - Infections respiratoires aiguës (grippe, bronchiolite, COVID-19). Bulletin du 8 octobre 2025 https://www.santepubliquefrance.fr/maladies-et-traumatismes/maladies-et-infections-respiratoires/grippe/documents/bulletin-national/infections-respiratoires-aigues-grippe-bronchiolite-covid-19-.-bulletin-du-8-octobre-2025
Santé publique France - Surveillance syndromique (SURSAUD) : https://www.santepubliquefrance.fr/surveillance-syndromique-sursaud-R/bulletins-sursaud-R-sos-medecins-oscour-mortalite
Taux d'incidence et indicateurs de soins primaires (S40) Réseau Sentinelles - Situation observée en soins primaires (IRA) https://www.sentiweb.fr/document/6677
Vaccination-info-service https://professionnels.vaccination-info-service.fr/Maladies-et-leurs-vaccins/COVID-19
Ameli - Recommandations vaccinales 2025/2026 Ameli.fr - Campagne de vaccination 2025/2026 contre le Covid-19 https://www.ameli.fr/assure/sante/themes/covid-19/vaccination-contre-le-covid-19/vaccination-covid19
Documents téléchargeables sur le site :
Santé publique France - IRA (grippe, bronchiolite, COVID-19) Bulletin du 8 octobre 2025